Forschungsgruppe Platzer

Genomanalyse

Genomik des Alterns – Modellorganismen und komplexe alternsbedingte Erkrankungen

Projekte (ausgewählt)

» Der "Stammbaum" von Ernst Haeckel (1874).

• Neues Modell für die Alternsforschung: Genomanalyse des kurzlebigen saisonalen Prachtgrundkärpflings (Nothobranchius furzeri) » mehr
• Erforschung natürlicher Wege zur Ausdehnung der Gesundheitsspanne bei extrem langlebigen Sandgräbern (Bathyergidae) (SAW) » mehr
• Milder Stress und gesundes Altern - vergleichende Transkriptomanalyse im Rahmen des Jenaer Zentrums für Systembiologie des Alterns » JenAge
• Bedeutung der DNA-Methylierung für das Altern des Gehirns (EU/BrainAGE)
• Einfluss von genetischen Varianten auf die Anfälligkeit für Sepsis und deren Verlauf (SEPTOMICS/CSCC)
• Unterstützung von Kooperationsprojekten durch genomische Expertise: Erkundung von Triticeae-Genomen mittels massiv-paralleler Sequenzierung (IPK); Olfaktorische Partnerwahl bei Fledermäusen und Hyänen (IZW)
• Entwicklung von bioinformatischen Verfahren zur Assemblierung und Repeat-Annotation komplexer Genome » mehr

Ausgewählte aktuelle Publikationen

• Kirschner J, Weber D, Neuschl C, Franke A, Böttger M, Zielke L, Powalsky E, Groth M, Shagin D, Petzold A, Hartmann N, Englert C, Brockmann GA, Platzer M, Cellerino A, Reichwald K. (2012) Mapping of quantitative trait loci controlling lifespan in the short-lived fish Nothobranchius furzeri - a new vertebrate model for age research. Aging Cell 11, 252-261. [PubMed]
• Zarse K, Schmeisser S, Groth M, Priebe S, Beuster G, Kuhlow D, Guthke R, Platzer M, Kahn CR, Ristow M. (2012) Impaired insulin/IGF1 signaling extends life span by promoting mitochondrial L-proline catabolism to induce a transient ROS signal. Cell Metab. 2012, 15, 451-465. [PubMed]
• Fritsch C, Herrmann A, Nothnagel M, Szafranski K, Huse K, Schumann F, Schreiber S, Platzer M, Krawczak M, Hampe J, Brosch M. (2012) Genome-wide search for novel human uORFs and N-terminal protein extensions using ribosomal footprinting. Genome Res. Oct 1, epub ahead of print. [PubMed]
• The International Barley Genome Sequencing Consortium. (2012) A physical, genetic and functional sequence assembly of the barley genome. Nature Oct 17, epub ahead of print. [PubMed]
• Heidel A, Lawal H, Felder M, Schilde C, Helps N, Tunggal B, Rivero F, John U, Schleicher M, Eichinger L, Platzer M, Noegel A, Schaap P, Glöckner G. (2011) Phylogeny-wide analysis of social amoeba genomes highlights ancient origins for complex intercellular communication. Genome Res. 21, 1882-1891. [PubMed]